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AI一秒提取化學結構！省100倍時間的化學繪圖神器StoneMIND Collector

來源：望石智慧      2021-11-30
導讀：選中任意文件中的化學結構后截圖，短短1秒就可以識別成計算機可編輯格式的結構文件。前幾天實驗室Boss推薦給我們這款極速提取化學結構軟件【StoneMIND Collector】（下文簡稱Collector），在深度使用兩周之后，感覺Collector真的是太好用了，而且還免費！！不敢獨享，特分享給大家。下
化學領域“畫結構式”這件事情，會耗費我們大量的工作時間，而且很容易畫錯。ChemDraw憑借強大繪圖功能已成為化學人首選結構繪制軟件，然而人類的本質是“懶惰”，AI技術的高速發展使一個圖片式的化學結構or一個化學名稱，瞬間轉變為一個可編輯、多重方式輸出的可用結構成為實現。利用AI軟件不僅能上百倍節省我們繪制化學結構時間，還能提升專業技能。
前幾天實驗室Boss推薦給我們這款極速提取化學結構軟件【StoneMIND Collector】（下文簡稱Collector），在深度使用兩周之后，感覺Collector真的是太好用了，而且還免費！！不敢獨享，特分享給大家。下載方式請查看文末鏈接。



推薦等級：★ ★ ★ ★ ★ 


使用方便+高準確度識別各類化學結構

選中任意文件中的化學結構后截圖，短短1秒就可以識別成計算機可編輯格式的結構文件。例如我們看到某篇專利或者文獻中想摘錄下來變成可編輯的化學結構，用Collector一鍵截圖即可省去繁瑣易出錯的繪制過程！！！以摘抄下方這個結構相對復雜的天然產物為例，如復制到PubChem數據庫的搜索框中，來獲得該分子的理化性質、生物活性等信息；識別準確度很不錯，瞬間給出清晰漂亮的化學結構，超贊~
Collector可將識別的分子結構一鍵復制為SMILES/MOL格式，如復制到PubChem數據庫的搜索框中，來獲得該分子的理化性質、生物活性等信息；也可直接下載分子結構為SDF格式，方便之后的使用。


微信圖片_20211130111935.gif




批量提取2000個結構僅需30分鐘！


面對有許多化學結構需要識別的情況，一次性識別多個結構是非常有必要的。使用Collector網頁版來進行專利或文獻中化學結構的批量提取，只需上傳.pdf文件格式或.jpg、.png圖片格式文件即可批量提取，專利的批量提取也可直接輸入專利號檢索提取，提取方法包括支持OCSR（化學結構識別）和 IUPAC（標準化學名稱識別）兩種技術。目前Collector批量提取任務（1個任務對應1個pdf/jpg/png格式的文件）提交后后臺會自動提取，待任務結束再查看和下載提取結構即可。


微信圖片_20211130111940.gif



其他超贊功能

在實際的應用中，化學結構的識別往往只是一個開始，思考和發展有利于后續科學研究的功能十分必要。如對于藥物設計學家來說，化學分子的理化性質分析及結構的優化功能或許很有用。當然，拋去核心需求的功能更多的是錦上添花，作為化學結構提取的軟件，首先應該保證的是快捷性和準確性。筆者看過一些對比數據文章，Collector識別準確度在同類型產品中已處于領先水平，強烈推薦大家使用。
Collector在完成圖片抓取后，通過“收藏”選項，可以將結構進行歷史保存。重點來了！！！通過打開左側工具欄的“收藏夾”，會跳轉到網頁，寶藏出現！！！。

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潛在寶藏&分子信息預測



通過上面的界面，大家可以一目了然的看到所謂的“寶藏”，即分子信息的預測。且不僅僅局限于上圖中的“類藥性、可合成性、溶解度、LogP、hERG”，將收藏的結構進一步點擊打開，還會有更為詳細的分子信息預測。具體如結構性質方面的類藥性、可合成性、氫鍵受體數目、氫鍵供體數目、極性分子表面積；理化性質方面的溶解度、logP；DMPK性質方面的Caco-2腸滲透性、生物利用度、血漿蛋白結合率、血腦屏蔽穿透率、PGP底物、CYP450抑制；毒性方面的hERG，等等。這些信息的反饋，對于藥學領域研究人員來說，極為珍貴！對于結構的理解，幫助極大！


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StoneMIND Collector給出的分子結構預測



綜上，就是這個軟件當前的使用體驗，話不多說，現總結如下：




? 免費

? 安裝方便，格式較小，兼容性好

? 界面簡單友好

? 圖片結構識別快速

? 可進行IUPAC（標準化學名稱）識別

? 抓取的結構可進行編輯

? 可輸出sdf/mol/smiles格式文件

? 收藏+歷史記錄

? 分子特性預測

? 多結構同時抓取


Windows & Mac版軟件獲取方式


Collector由國內AI制藥公司北京望石智慧科技有限公司開發，以下信息從官方摘抄


下載地址（復制至PC端瀏覽器打開，點擊下載客戶端即可）

https://stonewise.cn/mol_product?channel=9


注意：部分用戶可能會遇到軟件包的下載安裝操作被自動攔截，這受限于您的電腦安全設置策略，請手動允許其下載和安裝，該軟件安全無毒，請放心使用。


溫馨提示


1.在Collector客戶端點擊左側導航欄圖標，即可觀看產品使用視頻。

2.打開望石智慧官網www.stonewise.cn，點擊產品介紹下的StoneMIND Collector, 有該產品的詳細介紹和使用視頻。

3.任何產品使用問題或建議可直接聯系Collector微信客服，請掃下方二維碼添加微信或工作日9：00-18：00撥打手機號15711471378(微信同號）。


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